Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkdcP97313 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkdcP97313 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkdcP97313 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkdcP97313 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkdcP97313 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkdcP97313 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkdcP97313 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkdcP97313 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkdcP97313 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkdcP97313 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkdcP97313 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkdcP97313 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkdcP97313 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkdcP97313 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkdcP97313 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkdcP97313 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkdcP97313 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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