Protein–RNA interactions for Protein: P84751

Ig heavy chain Mem5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P84751 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P84751 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P84751 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P84751 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P84751 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P84751 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P84751 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P84751 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P84751 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P84751 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P84751 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P84751 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P84751 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P84751 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P84751 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
P84751 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P84751 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P84751 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P84751 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms