Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctps1P70698 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctps1P70698 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctps1P70698 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctps1P70698 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctps1P70698 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctps1P70698 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctps1P70698 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctps1P70698 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctps1P70698 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctps1P70698 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctps1P70698 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctps1P70698 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctps1P70698 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctps1P70698 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctps1P70698 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctps1P70698 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctps1P70698 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctps1P70698 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms