Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad1P70340 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad1P70340 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad1P70340 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad1P70340 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad1P70340 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad1P70340 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad1P70340 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad1P70340 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad1P70340 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms