Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frat1P70339 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frat1P70339 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frat1P70339 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frat1P70339 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frat1P70339 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frat1P70339 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms