Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aup1P70295 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Aup1P70295 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aup1P70295 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aup1P70295 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aup1P70295 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Aup1P70295 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aup1P70295 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Aup1P70295 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aup1P70295 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms