Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sycp3P70281 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sycp3P70281 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sycp3P70281 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms