Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Surf6P70279 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf6P70279 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf6P70279 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf6P70279 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf6P70279 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf6P70279 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf6P70279 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms