Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chl1P70232 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chl1P70232 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chl1P70232 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Chl1P70232 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chl1P70232 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chl1P70232 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chl1P70232 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chl1P70232 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chl1P70232 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chl1P70232 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chl1P70232 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chl1P70232 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chl1P70232 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chl1P70232 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chl1P70232 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms