Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg1P63260 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actg1P63260 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg1P63260 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg1P63260 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actg1P63260 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actg1P63260 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg1P63260 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actg1P63260 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg1P63260 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg1P63260 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actg1P63260 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms