Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtnP63089 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtnP63089 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtnP63089 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtnP63089 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtnP63089 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtnP63089 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtnP63089 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtnP63089 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtnP63089 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtnP63089 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtnP63089 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtnP63089 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtnP63089 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtnP63089 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtnP63089 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtnP63089 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtnP63089 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtnP63089 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtnP63089 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtnP63089 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtnP63089 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtnP63089 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtnP63089 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtnP63089 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtnP63089 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtnP63089 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtnP63089 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtnP63089 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtnP63089 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtnP63089 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtnP63089 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtnP63089 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtnP63089 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtnP63089 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtnP63089 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtnP63089 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtnP63089 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtnP63089 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms