Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThraP63058 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThraP63058 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThraP63058 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThraP63058 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThraP63058 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThraP63058 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ThraP63058 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ThraP63058 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ThraP63058 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ThraP63058 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ThraP63058 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ThraP63058 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ThraP63058 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ThraP63058 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThraP63058 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThraP63058 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThraP63058 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThraP63058 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThraP63058 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThraP63058 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThraP63058 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThraP63058 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThraP63058 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThraP63058 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThraP63058 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThraP63058 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThraP63058 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThraP63058 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThraP63058 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThraP63058 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThraP63058 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThraP63058 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThraP63058 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ThraP63058 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThraP63058 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThraP63058 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThraP63058 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThraP63058 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThraP63058 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThraP63058 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ThraP63058 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ThraP63058 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ThraP63058 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ThraP63058 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ThraP63058 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThraP63058 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThraP63058 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThraP63058 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThraP63058 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ThraP63058 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThraP63058 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThraP63058 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThraP63058 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ThraP63058 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ThraP63058 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ThraP63058 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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