Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp2P63044 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp2P63044 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp2P63044 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp2P63044 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vamp2P63044 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp2P63044 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms