Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pou3f4P62515 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou3f4P62515 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou3f4P62515 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms