Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SnrpeP62305 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnrpeP62305 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms