Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vbp1P61759 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vbp1P61759 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms