Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme3P61290 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme3P61290 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme3P61290 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme3P61290 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme3P61290 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psme3P61290 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psme3P61290 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psme3P61290 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms