Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sem1P60897 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sem1P60897 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sem1P60897 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sem1P60897 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sem1P60897 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sem1P60897 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sem1P60897 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sem1P60897 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sem1P60897 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sem1P60897 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sem1P60897 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms