Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rin3P59729 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rin3P59729 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rin3P59729 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rin3P59729 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rin3P59729 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rin3P59729 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rin3P59729 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rin3P59729 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rin3P59729 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rin3P59729 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rin3P59729 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rin3P59729 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rin3P59729 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rin3P59729 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms