Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Vps33bP59016 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps33bP59016 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vps33bP59016 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vps33bP59016 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps33bP59016 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Vps33bP59016 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vps33bP59016 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Vps33bP59016 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps33bP59016 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps33bP59016 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps33bP59016 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Vps33bP59016 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms