Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctdsp1P58466 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctdsp1P58466 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctdsp1P58466 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms