Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dpf3P58269 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dpf3P58269 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dpf3P58269 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dpf3P58269 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms