Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FusP56959 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FusP56959 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FusP56959 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FusP56959 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FusP56959 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FusP56959 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FusP56959 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FusP56959 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FusP56959 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FusP56959 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FusP56959 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FusP56959 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FusP56959 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FusP56959 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FusP56959 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FusP56959 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FusP56959 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FusP56959 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FusP56959 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FusP56959 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FusP56959 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FusP56959 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FusP56959 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FusP56959 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FusP56959 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FusP56959 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FusP56959 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FusP56959 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FusP56959 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FusP56959 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FusP56959 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FusP56959 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FusP56959 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FusP56959 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FusP56959 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FusP56959 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FusP56959 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms