Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c40P56657 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c40P56657 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp2c40P56657 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cyp2c40P56657 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms