Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb3P54754 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb3P54754 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms