Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacnb3P54285 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacnb3P54285 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacnb3P54285 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacnb3P54285 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms