Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Efnb1P52795 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Efnb1P52795 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efnb1P52795 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms