Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ClgnP52194 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClgnP52194 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClgnP52194 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ClgnP52194 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClgnP52194 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClgnP52194 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClgnP52194 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms