Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SqleP52019 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SqleP52019 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SqleP52019 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SqleP52019 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SqleP52019 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SqleP52019 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SqleP52019 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SqleP52019 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SqleP52019 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SqleP52019 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SqleP52019 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SqleP52019 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SqleP52019 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SqleP52019 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SqleP52019 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SqleP52019 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SqleP52019 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SqleP52019 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SqleP52019 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SqleP52019 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SqleP52019 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SqleP52019 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SqleP52019 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SqleP52019 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SqleP52019 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SqleP52019 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SqleP52019 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SqleP52019 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SqleP52019 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SqleP52019 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SqleP52019 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SqleP52019 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SqleP52019 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SqleP52019 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SqleP52019 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SqleP52019 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SqleP52019 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SqleP52019 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SqleP52019 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SqleP52019 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SqleP52019 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SqleP52019 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SqleP52019 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SqleP52019 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SqleP52019 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SqleP52019 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SqleP52019 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SqleP52019 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SqleP52019 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SqleP52019 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SqleP52019 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SqleP52019 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SqleP52019 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SqleP52019 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SqleP52019 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SqleP52019 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SqleP52019 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SqleP52019 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SqleP52019 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SqleP52019 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SqleP52019 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SqleP52019 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SqleP52019 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SqleP52019 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SqleP52019 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SqleP52019 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SqleP52019 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SqleP52019 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SqleP52019 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SqleP52019 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SqleP52019 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SqleP52019 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SqleP52019 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SqleP52019 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SqleP52019 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SqleP52019 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SqleP52019 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SqleP52019 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SqleP52019 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SqleP52019 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SqleP52019 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SqleP52019 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SqleP52019 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SqleP52019 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SqleP52019 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SqleP52019 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SqleP52019 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms