Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa9P50707 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa9P50707 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa9P50707 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa9P50707 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms