Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd7P50283 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd7P50283 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd7P50283 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd7P50283 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms