Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cxcl5P50228 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl5P50228 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms