Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LmnaP48678 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LmnaP48678 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LmnaP48678 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LmnaP48678 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LmnaP48678 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LmnaP48678 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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