Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx2P48379 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rfx2P48379 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx2P48379 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms