Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VdrP48281 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VdrP48281 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VdrP48281 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VdrP48281 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VdrP48281 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VdrP48281 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VdrP48281 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VdrP48281 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VdrP48281 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VdrP48281 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VdrP48281 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VdrP48281 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VdrP48281 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VdrP48281 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VdrP48281 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VdrP48281 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VdrP48281 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VdrP48281 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VdrP48281 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VdrP48281 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VdrP48281 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VdrP48281 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VdrP48281 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VdrP48281 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VdrP48281 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VdrP48281 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VdrP48281 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VdrP48281 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VdrP48281 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VdrP48281 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VdrP48281 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VdrP48281 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VdrP48281 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VdrP48281 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VdrP48281 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VdrP48281 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VdrP48281 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VdrP48281 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VdrP48281 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VdrP48281 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VdrP48281 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VdrP48281 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VdrP48281 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VdrP48281 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VdrP48281 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VdrP48281 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VdrP48281 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VdrP48281 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VdrP48281 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VdrP48281 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VdrP48281 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VdrP48281 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VdrP48281 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VdrP48281 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VdrP48281 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VdrP48281 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VdrP48281 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms