Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tacr3P47937 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tacr3P47937 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tacr3P47937 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms