Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf4P47741 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf4P47741 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf4P47741 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf4P47741 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf4P47741 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms