Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CskP41241 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CskP41241 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CskP41241 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CskP41241 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CskP41241 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CskP41241 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CskP41241 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CskP41241 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CskP41241 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CskP41241 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CskP41241 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CskP41241 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CskP41241 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CskP41241 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CskP41241 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CskP41241 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CskP41241 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CskP41241 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CskP41241 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CskP41241 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CskP41241 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CskP41241 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CskP41241 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CskP41241 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CskP41241 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CskP41241 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CskP41241 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CskP41241 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CskP41241 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CskP41241 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CskP41241 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CskP41241 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CskP41241 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CskP41241 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CskP41241 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CskP41241 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CskP41241 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CskP41241 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CskP41241 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CskP41241 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CskP41241 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CskP41241 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CskP41241 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CskP41241 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CskP41241 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CskP41241 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CskP41241 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CskP41241 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CskP41241 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CskP41241 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CskP41241 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CskP41241 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CskP41241 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CskP41241 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CskP41241 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CskP41241 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CskP41241 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CskP41241 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CskP41241 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CskP41241 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CskP41241 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CskP41241 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CskP41241 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CskP41241 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CskP41241 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CskP41241 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms