Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Timp3P39876 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timp3P39876 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Timp3P39876 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Timp3P39876 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Timp3P39876 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Timp3P39876 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Timp3P39876 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Timp3P39876 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Timp3P39876 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms