Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TtlP38585 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TtlP38585 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TtlP38585 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtlP38585 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtlP38585 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtlP38585 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtlP38585 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TtlP38585 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtlP38585 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtlP38585 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtlP38585 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TtlP38585 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtlP38585 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtlP38585 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TtlP38585 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtlP38585 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TtlP38585 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TtlP38585 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TtlP38585 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtlP38585 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtlP38585 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtlP38585 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtlP38585 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtlP38585 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TtlP38585 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TtlP38585 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TtlP38585 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TtlP38585 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TtlP38585 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TtlP38585 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TtlP38585 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TtlP38585 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TtlP38585 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TtlP38585 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TtlP38585 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TtlP38585 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms