Protein–RNA interactions for Protein: P35492

Hal, Histidine ammonia-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HalP35492 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HalP35492 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HalP35492 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HalP35492 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HalP35492 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HalP35492 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HalP35492 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HalP35492 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HalP35492 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HalP35492 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HalP35492 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HalP35492 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HalP35492 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HalP35492 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HalP35492 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HalP35492 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HalP35492 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HalP35492 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HalP35492 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HalP35492 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HalP35492 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HalP35492 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HalP35492 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HalP35492 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HalP35492 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HalP35492 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HalP35492 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HalP35492 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HalP35492 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HalP35492 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HalP35492 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HalP35492 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HalP35492 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HalP35492 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HalP35492 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HalP35492 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HalP35492 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HalP35492 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HalP35492 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HalP35492 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HalP35492 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HalP35492 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HalP35492 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HalP35492 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HalP35492 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HalP35492 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HalP35492 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HalP35492 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HalP35492 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HalP35492 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HalP35492 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HalP35492 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HalP35492 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HalP35492 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HalP35492 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HalP35492 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HalP35492 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HalP35492 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HalP35492 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HalP35492 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HalP35492 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HalP35492 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HalP35492 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HalP35492 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HalP35492 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HalP35492 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms