Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin1P35438 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin1P35438 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin1P35438 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin1P35438 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grin1P35438 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin1P35438 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin1P35438 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grin1P35438 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grin1P35438 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms