Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxc5P32043 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc5P32043 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc5P32043 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms