Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd28P31041 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd28P31041 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd28P31041 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd28P31041 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd28P31041 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd28P31041 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd28P31041 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd28P31041 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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