Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk4P30285 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk4P30285 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk4P30285 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms