Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pabpc1P29341 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pabpc1P29341 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc1P29341 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms