Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcdP28867 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcdP28867 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms