Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CftrP26361 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CftrP26361 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CftrP26361 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CftrP26361 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CftrP26361 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CftrP26361 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CftrP26361 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CftrP26361 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CftrP26361 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CftrP26361 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CftrP26361 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CftrP26361 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CftrP26361 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CftrP26361 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CftrP26361 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CftrP26361 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CftrP26361 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CftrP26361 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CftrP26361 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CftrP26361 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CftrP26361 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CftrP26361 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CftrP26361 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CftrP26361 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CftrP26361 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CftrP26361 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CftrP26361 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CftrP26361 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CftrP26361 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CftrP26361 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CftrP26361 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CftrP26361 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CftrP26361 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CftrP26361 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CftrP26361 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CftrP26361 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CftrP26361 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CftrP26361 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CftrP26361 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CftrP26361 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CftrP26361 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CftrP26361 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CftrP26361 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CftrP26361 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CftrP26361 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CftrP26361 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CftrP26361 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CftrP26361 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CftrP26361 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CftrP26361 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CftrP26361 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CftrP26361 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CftrP26361 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CftrP26361 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CftrP26361 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CftrP26361 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CftrP26361 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CftrP26361 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CftrP26361 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CftrP26361 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CftrP26361 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CftrP26361 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CftrP26361 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CftrP26361 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CftrP26361 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CftrP26361 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CftrP26361 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CftrP26361 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CftrP26361 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CftrP26361 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CftrP26361 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CftrP26361 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CftrP26361 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CftrP26361 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CftrP26361 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CftrP26361 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CftrP26361 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CftrP26361 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CftrP26361 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CftrP26361 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CftrP26361 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CftrP26361 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CftrP26361 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CftrP26361 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CftrP26361 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CftrP26361 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CftrP26361 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CftrP26361 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms