Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd247P24161 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd247P24161 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cd247P24161 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd247P24161 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd247P24161 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd247P24161 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd247P24161 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd247P24161 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd247P24161 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms