Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria2P23819 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria2P23819 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria2P23819 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gria2P23819 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria2P23819 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms